天智朝八年(669年),,中臣鐮足死,天智天皇以其參與大化改革之功,,賜姓藤原朝臣,,是本姓之始。其后文武天皇詔,,只準(zhǔn)其子不比等姓藤原,。壬申之亂后,不比等參加撰修律令,,營(yíng)造平城京,,創(chuàng)下政治基礎(chǔ)。其女光明子立為皇后,,開(kāi)藤原氏一族立后之端,。不比等有四子:武智麻呂(南家),、房前(北家)、宇合(式家),、麻呂(京家),,是律令制下政治勢(shì)力強(qiáng)大的四家。其后三家在爭(zhēng)權(quán)中失勢(shì),,只北家獨(dú)榮不衰,。到藤原良房時(shí),以外戚出任攝關(guān)職,,以攝政或關(guān)白之名義長(zhǎng)期左右朝政,,稱(chēng)為攝關(guān)政治,是北家的全盛時(shí)期,,并確立攝政關(guān)白由北家嫡流出任的傳統(tǒng),。及至道長(zhǎng)當(dāng)政以后,藤原氏專(zhuān)權(quán)達(dá)于極盛期,。此期間藤原氏以外戚干政,,為所欲為,二后并立,,四女三妃,。東宮立妃,幼小天皇常住其家,。攝政,、關(guān)白、太政大臣,、左右大臣之職為藤原氏一族獨(dú)霸,,形成攝關(guān)政治特殊體制。北家嫡流(被稱(chēng)為攝關(guān)家)在平安時(shí)代末期分為近衛(wèi),、松殿,、九條三家。
寬治元年(1087年),,院政開(kāi)始,,實(shí)權(quán)轉(zhuǎn)入院政,藤原氏勢(shì)力稍衰,,形式上攝關(guān)職仍由藤原氏一家出任,。平氏興起,武士開(kāi)始執(zhí)政,,藤原氏的攝關(guān)政治體制名存實(shí)亡,。在鐮倉(cāng)時(shí)代由近衛(wèi)家分出鷹司家,由九條家分出二條家和一條家,,近衛(wèi),、鷹司、九條,、二條,、一條被稱(chēng)為五攝家,交替出任攝關(guān)職,,直至江戶(hù)末期,,但攝關(guān)職已與政權(quán)無(wú)關(guān)系。
明治維新后,,五攝家列為華族之首獲公爵稱(chēng)號(hào),。藤原氏一族在政壇上活躍近一千年。不過(guò)在明治時(shí)代,,因?yàn)樘旎氏铝钏腥嗣穸家幸粋€(gè)姓氏,有部份地區(qū)人改姓藤原,,但這些人物與歷史上真正的藤原氏無(wú)關(guān),,在藤原氏頗為普遍。