寺院占地68畝,。凈慧寺相傳原是三國時期周瑜水軍行轅,,南朝義將儲福路經(jīng)此處,因觀其地瀕萬傾太湖,,地勢軒敞,,包孕吳越,遂改建成寺,距今已有一千四百多年歷史,。
最先引人注意的是樹在前面的兩塊高高的長方形石條,,仔細看原來是用來樹旗桿的,上面隱約刻著文字和圖案,,但已模糊看不清了,。在南面有一水潭,因為西面一座小橋,,所以不知原來是河還是廟前的水池,。在潭邊有幾塊很大的石頭,從殘留的石刻知道這是寺廟從前建筑的遺跡,,想當年它們會是多么氣勢雄偉,,如今只能靜靜地躺著與倒在這里的香灰相伴,前面還有兩座石塔,,是后人新刻的,,不知從它們身上能否看到那殘石的影子。邊上還有一塊石頭,,從不同的角度看像豬,、像魚、像獸……也許稱得上是寺廟的一個寶貝了,。
據(jù)史載:大宋紹定年間,,香火盛期,有僧侶三百余眾,,寺田五百余畝。明朝朱元璋軍師劉伯溫到凈慧寺,,有香花橋上度六步,,河水倒轉向西流之傳說。如今寺內還保留有老營橋,、六步橋,、兵工橋,寺內有將軍墓,、雙塔蓮花石幢,、和尚墳、旗桿石,、古桂花樹等古跡村名,。
清乾隆皇帝到常州指定要游凈慧寺,因一時無法修通道路,,無錫官員將凈慧寺匾額移到無錫崇安寺,,乾隆御賜赦重建凈慧寺匾額,并留詩一首曰:南海蓮花九品香,,西方綠竹千年翠,。