1952年畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院醫(yī)療系本科,。
1953年8月返回上海醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院任內(nèi)科助教。
1955年師從著名老中醫(yī)姜春華教授,。
1959年師徒共獲衛(wèi)生部頒發(fā)的“發(fā)揚(yáng)醫(yī)學(xué)遺產(chǎn)”金質(zhì)獎(jiǎng)?wù)隆?/p>
1997年當(dāng)選為中國(guó)科學(xué)院院士,。
2019年3月7日因病逝世,享年91歲,。
2019年9月29日,,人力資源社會(huì)保障部、國(guó)家衛(wèi)生健康委,、國(guó)家中醫(yī)藥局決定,,追授沈自尹同志“全國(guó)中醫(yī)藥杰出貢獻(xiàn)獎(jiǎng)”稱號(hào),。
歷任復(fù)旦大學(xué)醫(yī)學(xué)院(原上海醫(yī)科大學(xué))校學(xué)位委員會(huì)委員,,上海市科協(xié)委員,中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合會(huì)副會(huì)長(zhǎng),,上海市中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會(huì)名譽(yù)會(huì)長(zhǎng),,全國(guó)中西醫(yī)結(jié)合虛癥與老年病專業(yè)委員會(huì)主任委員,衛(wèi)生部第四屆藥品審評(píng)委員會(huì)委員,,上海市中藥審評(píng)委員會(huì)主任委員,,中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合雜志及中西醫(yī)結(jié)合實(shí)用臨床急救雜志副總編。
曾任中西醫(yī)結(jié)合研究所所長(zhǎng),,中醫(yī)教研室主任,,華山醫(yī)院中醫(yī)科主任,臟象研究室主任,,博士研究生導(dǎo)師,,校及醫(yī)院學(xué)位和學(xué)術(shù)委員,國(guó)務(wù)院學(xué)位委員會(huì)醫(yī)學(xué)評(píng)議委員,,衛(wèi)生部中藥審評(píng)委員會(huì)主任委員,,上海市中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會(huì)會(huì)長(zhǎng),上海市中醫(yī)學(xué)會(huì)副會(huì)長(zhǎng),。上海市中醫(yī)藥專業(yè)委員會(huì)副主任委員,,國(guó)家自然科學(xué)基金評(píng)審委員,。
曾任《中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合雜志》副總編。中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會(huì)第三,、四屆副會(huì)長(zhǎng),,上海市中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會(huì)第二、第三屆會(huì)長(zhǎng),、名譽(yù)會(huì)長(zhǎng),。
以第一作者發(fā)表論文100余篇,主編腎的研究等6部中西醫(yī)結(jié)合學(xué)術(shù)專著,。
1979年獲全國(guó)醫(yī)學(xué)衛(wèi)生科學(xué)大會(huì)重大科技成果獎(jiǎng),。
1981、1983,、1985和1987年分別獲衛(wèi)生部乙級(jí)科技成果獎(jiǎng),,多次獲上海市科技進(jìn)步獎(jiǎng)。
1992年獲國(guó)家教委科技進(jìn)步獎(jiǎng),,共計(jì)16項(xiàng),。
1996年獲廣州仲景中醫(yī)藥杰出成果獎(jiǎng)。