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截至2025年4月,，南京醫(yī)科大學(xué)建有江寧校區(qū)、五臺(tái)校區(qū)和常州校區(qū)（籌）,。學(xué)位授權(quán)點(diǎn)覆蓋醫(yī)學(xué),、理學(xué)、工學(xué),、管理學(xué),、法學(xué)、教育學(xué)和文學(xué)7個(gè)學(xué)科門類,，臨床醫(yī)學(xué),、藥理學(xué)與毒理學(xué)、分子生物學(xué)與遺傳學(xué)學(xué)科位列ESI全球排名前1‰,。學(xué)校入選教育部基礎(chǔ)學(xué)科拔尖學(xué)生培養(yǎng)計(jì)劃2.0基地,，國(guó)家級(jí)一流本科專業(yè)建設(shè)點(diǎn)占全校專業(yè)總數(shù)近八成，建有一大批國(guó)家級(jí)教學(xué)平臺(tái)和課程資源,，獲國(guó)家級(jí)教學(xué)成果獎(jiǎng),。學(xué)校招生、培養(yǎng)和就業(yè)工作廣受社會(huì)各界好評(píng),，畢業(yè)生執(zhí)業(yè)醫(yī)師資格考試通過(guò)率位居國(guó)內(nèi)同類院校前列,，畢業(yè)生就業(yè)率始終保持在96%以上,。

學(xué)校建有生殖醫(yī)學(xué)與子代健康全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、環(huán)境與人類健康國(guó)際聯(lián)合研究中心,、腫瘤個(gè)體化醫(yī)學(xué)省部共建協(xié)同創(chuàng)新中心等50多個(gè)國(guó)家級(jí),、省部級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（工程研究中心、創(chuàng)新中心）,。擁有國(guó)內(nèi)一流的醫(yī)學(xué)模擬教育中心和江蘇省醫(yī)藥動(dòng)物實(shí)驗(yàn)基地,，建有省內(nèi)唯一的省級(jí)衛(wèi)生政策智庫(kù)—江蘇省健康研究院。學(xué)校積極面向生命健康領(lǐng)域的國(guó)家重大需求,，組建了基礎(chǔ)科學(xué)中心,、創(chuàng)新研究群體等重大科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)；承擔(dān)各類重大,、重點(diǎn)國(guó)家科技計(jì)劃項(xiàng)目近百項(xiàng),；代表性研究成果在《自然》《科學(xué)》等頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊發(fā)表，獲得了以國(guó)家自然科學(xué)二等獎(jiǎng)為代表的一批國(guó)家級(jí)和省部級(jí)科研成果獎(jiǎng)項(xiàng),。

學(xué)校堅(jiān)持“開(kāi)門辦學(xué)”,，與各級(jí)政府，國(guó)內(nèi)外高等院校,、科研機(jī)構(gòu),、社會(huì)團(tuán)體等建立了形式多樣的聯(lián)系與合作。學(xué)校先后與美國(guó),、俄羅斯,、加拿大、澳大利亞,、瑞典,、日本等國(guó)家和香港、澳門,、臺(tái)灣地區(qū)的醫(yī)學(xué)院?；蚩蒲袡C(jī)構(gòu)建立了良好的戰(zhàn)略合作和學(xué)術(shù)交流關(guān)系。

“十四五”期間,，學(xué)校堅(jiān)持以習(xí)近平新時(shí)代中國(guó)特色社會(huì)主義思想為指引,，聚焦一流學(xué)科、一流附屬醫(yī)院和一流辦學(xué)條件,，凝心聚力,、統(tǒng)籌施策、開(kāi)拓創(chuàng)新,、改革攻堅(jiān),，努力建成特色鮮明的“雙一流”醫(yī)科大學(xué)。

南京醫(yī)科大學(xué)創(chuàng)建于1934年，時(shí)名江蘇省立醫(yī)政學(xué)院,。1957年,，由鎮(zhèn)江遷至南京,，更名為南京醫(yī)學(xué)院,。1962年，被列為全國(guó)首批六年制醫(yī)藥院校,。1981年,，被批準(zhǔn)為全國(guó)首批博士、碩士學(xué)位授予單位,。1993年,，更名為南京醫(yī)科大學(xué)。

1993年12月3日,，國(guó)家教委正式批準(zhǔn)南京醫(yī)學(xué)院更名為“南京醫(yī)科大學(xué)”,。

2003年9月,，南京醫(yī)科大學(xué)江寧校區(qū)正式啟用。

2011年1月13日,，南京醫(yī)科大學(xué)與江寧區(qū)人民政府合作共建南京醫(yī)科大學(xué)附屬明德醫(yī)院,，南京醫(yī)科大學(xué)和江寧區(qū)人民政府將于江寧區(qū)共建一所新醫(yī)院。2016年2月教育部發(fā)文,，香港邵逸夫基金會(huì)已同意向南京醫(yī)科大學(xué)捐資2億港幣，用于醫(yī)院的建設(shè)與發(fā)展，“南京醫(yī)科大學(xué)附屬明德醫(yī)院”正式更名為“南京醫(yī)科大學(xué)附屬逸夫醫(yī)院”,。

2012年11月9日，入選第一批卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計(jì)劃項(xiàng)目試點(diǎn)高校，承擔(dān)“五年制臨床醫(yī)學(xué)人才培養(yǎng)模式改革試點(diǎn)”一項(xiàng)改革試點(diǎn)項(xiàng)目。

2015年9月21日,，江蘇省人民政府,、原國(guó)家衛(wèi)生計(jì)生委、教育部聯(lián)合發(fā)文,，決定共建南京醫(yī)科大學(xué),，學(xué)校正式列入省部部共建高校。

2018年3月5日,，江北新區(qū)與南京醫(yī)科大學(xué)舉行校地合作簽約儀式,將以南京市浦口醫(yī)院為基礎(chǔ),，共建南京醫(yī)科大學(xué)第四附屬醫(yī)院。3月23日，整合該校第一附屬醫(yī)院、附屬南京兒童醫(yī)院,、南京婦幼保健院及第二附屬醫(yī)院的優(yōu)質(zhì)兒科醫(yī)療教學(xué)資源，在兒科學(xué)系基礎(chǔ)上成立南京醫(yī)科大學(xué)兒科學(xué)院。10月30日,，南京醫(yī)科大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程與信息學(xué)院成立,。

2020年7月8日，無(wú)錫市人民政府,、南京醫(yī)科大學(xué)合作的南京醫(yī)科大學(xué)附屬無(wú)錫人民醫(yī)院揭牌,，標(biāo)志著無(wú)錫市人民醫(yī)院正式納入南京醫(yī)科大學(xué)直屬附屬醫(yī)院管理體系,，成為南京醫(yī)科大學(xué)在寧外第一家直屬附屬醫(yī)院。8月31日,，南京市疾病預(yù)防控制中心正式掛牌成為南京醫(yī)科大學(xué)附屬南京疾病預(yù)防控制中心,。

2021年10月11日，入選江蘇高水平大學(xué)建設(shè)高峰計(jì)劃A類建設(shè)高校,。11月29日,，學(xué)校“基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)拔尖學(xué)生培養(yǎng)基地”入選國(guó)家基礎(chǔ)學(xué)科拔尖學(xué)生培養(yǎng)計(jì)劃2.0基地,。

2022年2月9日,，入選教育部公布的第二輪“雙一流”建設(shè)高校及建設(shè)學(xué)科名單。

2023年8月18日,，學(xué)校與常州市簽約共建南京醫(yī)科大學(xué)常州校區(qū),。

2024年7月5日，南京醫(yī)科大學(xué)第三附屬醫(yī)院揭牌儀式在常州市第二人民醫(yī)院陽(yáng)湖院區(qū)舉行,。

2025年4月3日,，南京醫(yī)科大學(xué)與江寧區(qū)人民政府簽署深化合作共建協(xié)議。4月7日,，貴州省衛(wèi)生健康委與南京醫(yī)科大學(xué)簽署合作共建協(xié)議,。

以上信息源自官網(wǎng)，數(shù)據(jù)截止至2025年4月,，請(qǐng)以官網(wǎng)為準(zhǔn),！